今鐘山境域夏朝時期，屬梁州荒裔；殷商時期，屬鬼方地；周朝時期，屬雍州荒裔；秦朝時期，屬夜郞國地；漢朝時期，屬益州部牂牁郡地；蜀漢時期，屬牂牁屬國羅甸地；晉朝時期，屬寧州所領牂牁郡地；宋齊時期，屬寧州平蠻郡地；梁隋時期，屬?蠻盧鹿部地、牂州、牂牁郡等；唐朝時期，屬羅甸國地，隸黔中道；宋朝時期，屬羅甸部羅氏鬼國；元朝時期，屬羅甸部羅氏鬼國、順元路宣撫司、順元路宣慰司等；明朝時期，屬貴州宣撫司、貴州宣慰司，隸貴州布政司；清朝時期，屬大定府、水城廳。

雍正十一年（1733年），設水城廳，劃大定府永順里、常平里歸水城廳管轄（現鐘山境域大部屬永順里、常平里）。

民國二年（1913年）1月，水城廳改為水城縣，屬貴西道水城縣。

民國十二年（1923年），屬貴州省水城縣。

1950年水城縣解放后屬畢節水城縣。

1966年屬畢節水城縣和貴州省水城特區。

1970年12月，設六盤水地區后屬六盤水地區水城特區。

1978年12月，設六盤水市后屬六盤水市水城特區。

1987年12月15日，《國務院關于貴州省撤銷水城特區設立六盤水市鐘山區和水城縣批復》（國函〔1987〕199號），批準設六盤水市鐘山區和水城縣。

1987年12月，國務院以國函[1987]199號文件批復：撤銷水城特區，設立六盤水市鐘山區和水城縣；以原水城特區的水城、大河、汪家寨、大灣、老鷹山、觀音山6個鎮和城關、教場、其林、德塢、鳳凰、白膩、月照、煤廠、以德、藝奇、納福、三合、二塘13個鄉為鐘山區的行政區。因市中心有上鐘山、下鐘山而得名。

1996年，鐘山區轄2個街道6鎮1鄉1個民族鄉：黃土坡街道、荷城街道、德塢鎮、大灣鎮、汪家寨鎮、大河鎮、老鷹山鎮、觀音山鎮、鳳凰鄉、月照彝族回族苗族鄉。區政府駐威水路。

200年第五次人口普查，鐘山區總人口453293人，其中：黃土坡街道125533人，荷城街道91632人，鳳凰街道32221人，德塢街道12052人，老鷹山鎮33181人，觀音山鎮9716人，大河鎮32486人，汪家寨鎮52957人，大灣鎮48267人，月照彝族回族苗族鄉15248人。

2000年末，鐘山區轄黃土坡、荷城、鳳凰、德塢4個街道，大灣、汪家寨、大河、老鷹山、觀音山5個鎮和月照彝族回族苗族，共有67個行政村、65個居委會。

2003年末，鐘山區總人口42.70萬人，其中非農業人口25.20萬人，占總人口的59.02%；少數民族人口7.9萬人，占18.50%。轄4個街道、4個鎮、1個民族鄉：黃土坡街道、荷城街道、鳳凰街道、德塢街道、老鷹山鎮、大河鎮、汪家寨鎮、大灣鎮、月照彝族回族苗族鄉。共有49個城市社區，21個居委會，53個村委會。

2007年末，全區總面積478.84平方千米，總人口45.91萬人，其中少數民族8.4萬人，非農業人口30.29萬人，轄4個街道、4個鎮、1個民族鄉，50個社區、19個居委會、53個行政村。

2010年末，常住人口61.76萬人。2011年末，鐘山區面積478平方千米，常住人口61.88萬人，戶籍人口49.73萬人，轄4個街道、4個鎮、1個民族鄉。

2013年5月21日，貴州省政府批復同意將鐘山區老鷹山鎮整建制劃歸水城縣管轄（黔府函[2013]105號），將水城縣雙戛彝族鄉整建制劃歸鐘山區管轄（黔府函[2013]106號），老鷹山鎮、雙戛彝族鄉行政區域和政府駐地不變，鐘山區、水城縣行政區域界線做相應變更。調整后，鐘山區轄4個街道、3個鎮、2個民族鄉：黃土坡街道、荷城街道、鳳凰街道、德塢街道、大河鎮、汪家寨鎮、大灣鎮、月照彝族回族苗族鄉、雙戛彝族鄉。